常用的冷却方法有：
①空气冷却法，通风冷吹向放置食品的隧道，或用1300～2000Pa的压差，使冷空气进入并穿过有气窗的食品包装箱，以加速产品的冷却。冷空气的温度、相对湿度和流速根据食品的种类确定，一般不使食品冻结，相对湿度常为90～95%。
②水冷却法，以水为热传导介质,用大容量的水泵使接近0℃的冷水喷洒在产品上。因水的热容量比空气大得多，传热效率高，大部分食品可在10～15分钟内冷却。用海水冷却鱼类时，速度快,温度均匀，且可延长保藏期。
我国通常采用的蒸发温度。蒸发温度与库房温度之差一般为10℃，果蔬冷库的蒸发温度一般设计为-1010℃左右，冻结物冷藏间为-28℃，冻结间为-33℃，而实际运行中，许多果蔬贮藏库的温差在15℃左右，而欧洲等经济发达国家，蒸发温度与库房温度之差一般为3~5℃。
设计时有问题，或实际贮藏品种与设计计划贮藏品种不同，热负荷增加，比如，拟贮藏苹果的冷库，用于贮藏蒜薹，由于一个产区的蒜薹采收期只有几天时间，无法做到同苹果那样每天的进货量按库容量的5%-15%，而是3~5天就要入满，因此，如要及时把温度降到适宜贮藏温度只能靠降低蒸发温度来实现。
压缩机冷量过大
库房负荷减小后，未及时减少压缩机的能量。冷库的压缩机是根据制冷系统负荷匹配的，而果蔬冷库的负荷是发生在货物入库阶段，其它大多数时间，压缩机的负荷不足50%。当入库结束温度降至适宜贮藏温度以后，系统负荷大大减少，如仍开启较大的机器，这样便形成了大马拉小车，温差增大，耗电量增大。
应根据库房负荷的变化减少压缩机开启台数或用能量调节装置减少工作缸数。